Replikacioni protein A : Reference Wikipedia, slobodna enciklopedija

Replikacioni protein A

Replikacioni protein A, C terminal

Identifikatori

Simbol

RPA_C

Pfam

PF08784

InterPro

IPR014892

Dostupne PDB strukture:
PDB 1dpu

Replikacioni protein A (RPA) je protein koji se vezuje za jednolačanu DNK u ćelijama eukariota.^[1] Tokom DNK replikacije, RPA sprečava jednolančanu DNK (ssDNA) da se uvije oko same sebe i formira sekundarne strukture. Time se DNK održava u odmotanom stanju tako da polimeraze mogu da je replikuju. RPA se takođe vezuje za ssDNK tokom inicijalne faze homologne rekombinacije, važnog procesa tokom DNK popravke i mejozne profaze I. Slično njenoj ulozi u DNK replikaciji, ona sprečava da se ssDNA veže za samu sebe (samokomplementuje), tako da se na rezultirajući nukleoproteinski filament mogu vezati Rad51 i njegovi kofaktori.^[2]

RPA se takođe vezuju za DNK tokom procesa popravke iscesanjem nukleotida. Ovo vezivanje stabilizuje kompleks tokom procesa popravke.

Bakterijski homolog se naziva protein jednolančanog vezivanja (engl. single-strand binding protein - SSB).

Reference

↑ Wold, MS (1997). „Replication protein A: heterotrimeric, single-stranded DNA-binding protein required for eukaryotic DNA metabolism”. Annual Review of Biochemistry 66 (1): 61–92. DOI:10.1146/annurev.biochem.66.1.61. PMID 9242902.
↑ Xuan, L; Wolf-Dietrich, H (2008). „Homologous recombination in DNA repair and DNA damage tolerance”. Cell Research 18 (99): 99–113. DOI:10.1038/cr.2008.1. PMID 18166982.

DNK replikacija (Prokariotska, Eukariotska)

Separacija
i inicijacija

Prokariotska (inicijacija)	Prereplikacioni kompleks Cdc6 Helikaza (dnaA, dnaB, T7) • Primaza (dnaG)
Eukariotska (priprema u G1 fazi)	Prereplikacioni kompleks: Kompleks prepoznavanja mesta početka (ORC1, ORC2, ORC3, ORC4, ORC5, ORC6) • Održavanje minihromozoma (MCM2 • MCM3 • MCM4 • MCM5 • MCM6 • MCM7) • CDC6 Faktor licenciranja Autonomna replikaciona sekvenca Protein jednolančanog vezivanja (SSBP1, SSBP2, SSBP3) RNaza H (RNASEH1, RNASEH2A) Helikaza: HFM1 Primaza: PRIM1 • PRIM2
Oba	Početak replikacije/Ori/Replikon Replikaciona viljuška (zaostajući i vodeći lanci) • Okazakijev fragment • Prajmer

Replikacija

Prokariotska (elongacija)	DNK polimeraza III holoenzim (dnaC, dnaE, dnaH, dnaN, dnaQ, dnaT, dnaX, holA, holB, holC, holD, holE) • Replizom • DNK ligaza • DNK stega • Topoizomeraza (DNK giraza) Prokariotska DNK polimeraza: DNK polimeraza I (Klenov fragment)
Eukariotska (sinteza u S fazi)	Replikacioni faktor C (RFC1, RFC2, RFC3, RFC4, RFC5) • Endonukleaza prepusta (FEN1) • Topoizomeraza • Replikacioni protein A (RPA1) Eukariotska DNK polimeraza: delta (POLD1, POLD2, POLD3, POLD4) DNK stega (PCNA)
Oba	Kretanje: Procesivnost • DNK ligaza

Terminacija

Telomera: Telomeraza (TERT, TERC, DKC1)

B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr) • tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts) • tltn (risu, pttl, nexn) • dnab, rnab/runp • stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)