DNK polimeraza III holoenzim

DNK polimeraza III holoenzim je primarni enzimski kompleks koji učestvuje u prokariotskoj replikaciji DNK. Thomas Kornberg i Malkolm Gefter su otkrili ovaj kompleks 1970. Kompleks je veoma efikasan, i.e. njegov broj dodatih nukleotida po vezivanju je visok. Pri replikaciji E.coli genoma on funkcioniše zajedno sa drugim DNK polimerazama (Pol I, Pol II, Pol IV, i Pol V). Kao primarni holoenzim procesa replikacije, DNK Pol III holoenzim takođe poseduje sposobnost korekture kojom se ispravljaju replikacione greške u 3'->5' smeru posredstvom dejstva egzonuklease. DNK Pol III je komponenta replizoma, koji je lociran na replikacionoj račvi.^[1][2]

Komponente

DNK polimeraza III, delta podjedinica atpgs vezan za e. coli kompleks vodiča klampe Identifikatori Simbol DNA_pol3_delta Pfam PF06144 Pfam klan CL0023 InterPro IPR010372 SKOP 1jql	DNK polimeraza III, delta podjedinica, C terminal adp vezan za e. coli kompleks vodiča klampe Identifikatori Simbol DNApol3-delta_C Pfam PF09115 InterPro IPR015199 SKOP 1a5t	Bakterijska DNK polimeraza III, alfa podjedinica Identifikatori Simbol DNA_pol3_alpha Pfam PF07733 InterPro IPR011708 DNA polimeraza III, podjedinica tau, domen IV Identifikatori Simbol DNA_pol3_tau_4 Pfam PF12168 InterPro IPR022001
DNK polimeraza III, teta podjedinica Struktura e. coli Pol III epsilon-hot korekcioni kompleks Identifikatori Simbol DNA_pol3_theta Pfam PF06440 InterPro IPR009052 SCOP 1du2 Superfamilija 1du2 Dostupne PDB strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe PDBsum strukturni pregled	DNK polimeraza III, či podjedinica, HolC Kristalna struktura či i psi podjedinice heterodimera DNK Pol III Identifikatori Simbol DNA_pol3_chi Pfam PF04364 InterPro IPR007459 SCOP 1em8 Superfamilija 1em8 Dostupne PDB strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe PDBsum strukturni pregled	DNK polimeraza III, tau podjedinica V u interakciji sa alfa Identifikatori Simbol DNA_pol3_tau_5 Pfam PF12170 InterPro IPR021029 Dostupne PDB strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe PDBsum strukturni pregled

Replizom se sastoji od sledećeg:

• 2 DNK Pol III enzima, svaki od njih sadrži α, ε and θ podjedinice.
  • α podjedinica ima polimeraznu aktivnost.
  • ε podjedinica ima 3'-5' egzonukleaznu aktivnost.
  • θ podjedinica stimuliše korekturu ε podjecinice.
• 2 β jedinice omogučavaju pomeranje DNK klamfe
• 2 τ jedinice dimerizuju dva sržna enzima (α, ε, i θ podjedinice).
• 1 γ jedinica pomaže β podjedinicama pri vezivanju za DNK.
• Χ i Ψ formiraju 1:1 kompleks i vezuju se za γ ili τ.^[1]

Reference

Literatura

Spoljašnje veze

• Pregled
• MeSH DNA+Polymerase+III