TRAF2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3M0D, 1CA4, 1CA9, 1CZY, 1CZZ, 1D00, 1D01, 1D0A, 1D0J, 1F3V, 1QSC, 3KNV, 3M06, 3M0A

Ідентифікатори

Символи

TRAF2, MGC:45012, TRAP, TRAP3, TNF receptor associated factor 2, RNF117

Зовнішні ІД

OMIM: 601895 MGI: 101835 HomoloGene: 22520 GeneCards: TRAF2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sphingolipid binding • lipid binding • CD40 receptor binding • mitogen-activated protein kinase kinase kinase binding • zinc ion binding • signal transducer activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • thioesterase binding • enzyme binding • protein phosphatase binding • protein kinase binding • ubiquitin protein ligase binding • transferase activity • tumor necrosis factor receptor binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• TRAF2-GSTP1 complex • AIP1-IRE1 complex • ubiquitin ligase complex • vesicle membrane • cell cortex • membrane raft • CD40 receptor complex • cytoplasmic side of plasma membrane • IRE1-TRAF2-ASK1 complex • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process • positive regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • positive regulation of JUN kinase activity • negative regulation of glial cell apoptotic process • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • protein K63-linked ubiquitination • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • activation of NF-kappaB-inducing kinase activity • positive regulation of protein homodimerization activity • response to endoplasmic reticulum stress • protein homotrimerization • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • positive regulation of I-kappaB phosphorylation • regulation of JNK cascade • GO:0044257 protein catabolic process • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-2 production • death-inducing signaling complex assembly • positive regulation of T cell cytokine production • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • cellular response to nitric oxide • regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • protein autoubiquitination • negative regulation of neuron death • programmed necrotic cell death • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • protein deubiquitination • protein heterooligomerization • GO:0034622 protein-containing complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7186


22030

Ensembl


ENSG00000127191


ENSMUSG00000026942

UniProt


Q12933


P39429

RefSeq (мРНК)


NM_021138


NM_009422 NM_001290413

RefSeq (білок)


NP_066961


NP_001277342 NP_033448

Локус (UCSC)

Хр. 9: 136.88 – 136.93 Mb

Хр. 2: 25.41 – 25.44 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRAF2 (англ. TNF receptor associated factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 55 859^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAASVTPPG	SLELLQPGFS	KTLLGTKLEA	KYLCSACRNV	LRRPFQAQCG
HRYCSFCLAS	ILSSGPQNCA	ACVHEGIYEE	GISILESSSA	FPDNAARREV
ESLPAVCPSD	GCTWKGTLKE	YESCHEGRCP	LMLTECPACK	GLVRLGEKER
HLEHECPERS	LSCRHCRAPC	CGADVKAHHE	VCPKFPLTCD	GCGKKKIPRE
KFQDHVKTCG	KCRVPCRFHA	IGCLETVEGE	KQQEHEVQWL	REHLAMLLSS
VLEAKPLLGD	QSHAGSELLQ	RCESLEKKTA	TFENIVCVLN	REVERVAMTA
EACSRQHRLD	QDKIEALSSK	VQQLERSIGL	KDLAMADLEQ	KVLEMEASTY
DGVFIWKISD	FARKRQEAVA	GRIPAIFSPA	FYTSRYGYKM	CLRIYLNGDG
TGRGTHLSLF	FVVMKGPNDA	LLRWPFNQKV	TLMLLDQNNR	EHVIDAFRPD
VTSSSFQRPV	NDMNIASGCP	LFCPVSKMEA	KNSYVRDDAI	FIKAIVDLTG
L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Song H.Y., Donner D.B. (1995). Association of a RING finger protein with the cytoplasmic domain of the human type-2 tumour necrosis factor receptor. Biochem. J. 309: 825—829. PMID 7639698 DOI:10.1042/bj3090825
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rothe M., Wong S.C., Henzel W.J., Goeddel D.V. (1994). A novel family of putative signal transducers associated with the cytoplasmic domain of the 75 kDa tumor necrosis factor receptor. Cell. 78: 681—692. PMID 8069916 DOI:10.1016/0092-8674(94)90532-0
Lee S.Y., Park C.G., Choi Y. (1996). T cell receptor-dependent cell death of T cell hybridomas mediated by the CD30 cytoplasmic domain in association with tumor necrosis factor receptor-associated factors. J. Exp. Med. 183: 669—674. PMID 8627180 DOI:10.1084/jem.183.2.669
Lee S.Y., Lee S.Y., Choi Y. (1997). TRAF-interacting protein (TRIP): a novel component of the tumor necrosis factor receptor (TNFR)- and CD30-TRAF signaling complexes that inhibits TRAF2-mediated NF-kappaB activation. J. Exp. Med. 185: 1275—1285. PMID 9104814 DOI:10.1084/jem.185.7.1275
Malinin N.L., Boldin M.P., Kovalenko A.V., Wallach D. (1997). MAP3K-related kinase involved in NF-kappaB induction by TNF, CD95 and IL-1. Nature. 385: 540—544. PMID 9020361 DOI:10.1038/385540a0

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12032 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q12933 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.