TLR5 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TLR5, MELIOS, SLE1, SLEB1, TIL3, toll like receptor 5 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603031 MGI: 1858171 HomoloGene: 20698 GeneCards: TLR5 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • transmembrane signaling receptor activity • interleukin-1 receptor binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана |
---|
Біологічний процес | • GO:0032737 positive regulation of cytokine production • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of toll-like receptor signaling pathway • defense response to bacterium • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • toll-like receptor 5 signaling pathway • процес імунної системи • positive regulation of interleukin-8 production • cellular response to mechanical stimulus • вроджений імунітет • inflammatory response |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6e/PBB_GE_TLR5_210166_at_fs.png/250px-PBB_GE_TLR5_210166_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 223.11 – 223.14 Mb | Хр. 1: 182.78 – 182.8 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TLR5 (англ. Toll like receptor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 97 834[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGDHLDLLLG | | VVLMAGPVFG | | IPSCSFDGRI | | AFYRFCNLTQ | | VPQVLNTTER |
LLLSFNYIRT | | VTASSFPFLE | | QLQLLELGSQ | | YTPLTIDKEA | | FRNLPNLRIL |
DLGSSKIYFL | | HPDAFQGLFH | | LFELRLYFCG | | LSDAVLKDGY | | FRNLKALTRL |
DLSKNQIRSL | | YLHPSFGKLN | | SLKSIDFSSN | | QIFLVCEHEL | | EPLQGKTLSF |
FSLAANSLYS | | RVSVDWGKCM | | NPFRNMVLEI | | LDVSGNGWTV | | DITGNFSNAI |
SKSQAFSLIL | | AHHIMGAGFG | | FHNIKDPDQN | | TFAGLARSSV | | RHLDLSHGFV |
FSLNSRVFET | | LKDLKVLNLA | | YNKINKIADE | | AFYGLDNLQV | | LNLSYNLLGE |
LYSSNFYGLP | | KVAYIDLQKN | | HIAIIQDQTF | | KFLEKLQTLD | | LRDNALTTIH |
FIPSIPDIFL | | SGNKLVTLPK | | INLTANLIHL | | SENRLENLDI | | LYFLLRVPHL |
QILILNQNRF | | SSCSGDQTPS | | ENPSLEQLFL | | GENMLQLAWE | | TELCWDVFEG |
LSHLQVLYLN | | HNYLNSLPPG | | VFSHLTALRG | | LSLNSNRLTV | | LSHNDLPANL |
EILDISRNQL | | LAPNPDVFVS | | LSVLDITHNK | | FICECELSTF | | INWLNHTNVT |
IAGPPADIYC | | VYPDSFSGVS | | LFSLSTEGCD | | EEEVLKSLKF | | SLFIVCTVTL |
TLFLMTILTV | | TKFRGFCFIC | | YKTAQRLVFK | | DHPQGTEPDM | | YKYDAYLCFS |
SKDFTWVQNA | | LLKHLDTQYS | | DQNRFNLCFE | | ERDFVPGENR | | IANIQDAIWN |
SRKIVCLVSR | | HFLRDGWCLE | | AFSYAQGRCL | | SDLNSALIMV | | VVGSLSQYQL |
MKHQSIRGFV | | QKQQYLRWPE | | DFQDVGWFLH | | KLSQQILKKE | | KEKKKDNNIP |
LQTVATIS |
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь. Локалізований у мембрані.
Література
- Wlasiuk G., Khan S., Switzer W.M., Nachman M.W. (2009). A history of recurrent positive selection at the toll-like receptor 5 in primates. Mol. Biol. Evol. 26: 937—949. PMID 19179655 DOI:10.1093/molbev/msp018
- Georgel P., Macquin C., Bahram S. (2009). The heterogeneous allelic repertoire of human Toll-Like receptor (TLR) genes. PLoS ONE. 4: E7803—E7803. PMID 19924287 DOI:10.1371/journal.pone.0007803
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Rock F.L., Hardiman G., Timans J.C., Kastelein R.A., Bazan J.F. (1998). A family of human receptors structurally related to Drosophila Toll. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 588—593. PMID 9435236 DOI:10.1073/pnas.95.2.588
- Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
- Zhou K., Kanai R., Lee P., Wang H.W., Modis Y. (2012). Toll-like receptor 5 forms asymmetric dimers in the absence of flagellin. J. Struct. Biol. 177: 402—409. PMID 22173220 DOI:10.1016/j.jsb.2011.12.002
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11851 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O60602 (англ.) . Архів оригіналу за 12 лютого 2018. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |