H1FOO

Ідентифікатори

Символи

H1-8, osH1, H1.8, H1oo, H1 histone family member O, oocyte specific, H1 histone family member O oocyte specific, H1.8 linker histone, H1FOO

Зовнішні ІД

MGI: 2176207 HomoloGene: 51377 GeneCards: H1-8

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • nucleosomal DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • Нуклеосома • екзосома • ядерце • клітинне ядро • хромосома • female germ cell nucleus
Біологічний процес	• nucleosome assembly • GO:0007126 мейоз • regulation of DNA methylation • negative regulation of stem cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chromosome condensation • negative regulation of DNA recombination
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


132243


171506

Ensembl


ENSG00000178804


ENSMUSG00000042279

UniProt


Q8IZA3


Q8VIK3

RefSeq (мРНК)


NM_001308262 NM_153833


NM_138311 NM_001346702

RefSeq (білок)


NP_001295191 NP_722575


NP_001333631 NP_612184

Локус (UCSC)

Хр. 3: 129.54 – 129.55 Mb

Хр. 6: 115.92 – 115.93 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

H1FOO (англ. H1 histone family member O oocyte specific) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 346 амінокислот, а молекулярна маса — 35 813^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPGSVTSDI	SPSSTSTAGS	SRSPESEKPG	PSHGGVPPGG	PSHSSLPVGR
RHPPVLRMVL	EALQAGEQRR	GTSVAAIKLY	ILHKYPTVDV	LRFKYLLKQA
LATGMRRGLL	ARPLNSKARG	ATGSFKLVPK	HKKKIQPRKM	APATAPRRAG
EAKGKGPKKP	SEAKEDPPNV	GKVKKAAKRP	AKVQKPPPKP	GAATEKARKQ
GGAAKDTRAQ	SGEARKVPPK	PDKAMRAPSS	AGGLSRKAKA	KGSRSSQGDA
EAYRKTKAES	KSSKPTASKV	KNGAASPTKK	KVVAKAKAPK	AGQGPNTKAA
APAKGSGSKV	VPAHLSRKTE	APKGPRKAGL	PIKASSSKVS	SQRAEA

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як мейоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

Tanaka Y., Kato S., Tanaka M., Kuji N., Yoshimura Y. (2003). Structure and expression of the human oocyte-specific histone H1 gene elucidated by direct RT-nested PCR of a single oocyte. Biochem. Biophys. Res. Commun. 304: 351—357. PMID 12711322 DOI:10.1016/S0006-291X(03)00610-7
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18463 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8IZA3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.