CAPN5 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CAPN5

Ідентифікатори

Символи

CAPN5, ADNIV, HTRA3, VRNI, nCL-3, calpain 5

Зовнішні ІД

OMIM: 602537 MGI: 1100859 HomoloGene: 31212 GeneCards: CAPN5

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity
Клітинна компонента	• cell surface • екзосома • внутрішньоклітинний • focal adhesion • цитоплазма
Біологічний процес	• GO:0072468 сигнальна трансдукція • протеоліз
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


726


12337

Ensembl


ENSG00000149260


ENSMUSG00000035547

UniProt


O15484


O08688

RefSeq (мРНК)


NM_004055


NM_001301250 NM_007602

RefSeq (білок)


NP_004046


NP_001288179 NP_031628

Локус (UCSC)

Хр. 11: 77.07 – 77.13 Mb

Хр. 7: 98.12 – 98.18 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CAPN5 (англ. Calpain 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 640 амінокислот, а молекулярна маса — 73 169^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFSCVKPYED	QNYSALRRDC	RRRKVLFEDP	LFPATDDSLY	YKGTPGPAVR
WKRPKGICED	PRLFVDGISS	HDLHQGQVGN	CWFVAACSSL	ASRESLWQKV
IPDWKEQEWD	PEKPNAYAGI	FHFHFWRFGE	WVDVVIDDRL	PTVNNQLIYC
HSNSRNEFWC	ALVEKAYAKL	AGCYQALDGG	NTADALVDFT	GGVSEPIDLT
EGDFANDETK	RNQLFERMLK	VHSRGGLISA	SIKAVTAADM	EARLACGLVK
GHAYAVTDVR	KVRLGHGLLA	FFKSEKLDMI	RLRNPWGERE	WNGPWSDTSE
EWQKVSKSER	EKMGVTVQDD	GEFWMTFEDV	CRYFTDIIKC	RVINTSHLSI
HKTWEEARLH	GAWTLHEDPR	QNRGGGCINH	KDTFFQNPQY	IFEVKKPEDE
VLICIQQRPK	RSTRREGKGE	NLAIGFDIYK	VEENRQYRMH	SLQHKAASSI
YINSRSVFLR	TDQPEGRYVI	IPTTFEPGHT	GEFLLRVFTD	VPSNCRELRL
DEPPHTCWSS	LCGYPQLVTQ	VHVLGAAGLK	DSPTGANSYV	IIKCEGDKVR
SAVQKGTSTP	EYNVKGIFYR	KKLSQPITVQ	VWNHRVLKDE	FLGQVHLKAD
PDNLQALHTL	HLRDRNSRQP	SNLPGTVAVH	ILSSTSLMAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз.

Література

Mugita N., Kimura Y., Ogawa M., Saya H., Nakao M. (1997). Identification of a novel, tissue-specific calpain htra-3; a human homologue of the Caenorhabditis elegans sex determination gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 239: 845—850. PMID 9367857 DOI:10.1006/bbrc.1997.7571
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dear T.N., Matena K., Vingron M., Boehm T. (1997). A new subfamily of vertebrate calpains lacking a calmodulin-like domain: implications for calpain regulation and evolution. Genomics. 45: 175—184. PMID 9339374 DOI:10.1006/geno.1997.4870

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1482 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O15484 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.