ABTB1 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

ABTB1

Ідентифікатори

Символи

ABTB1, BPOZ, BTB3, BTBD21, EF1ABP, PP2259, ankyrin repeat and BTB domain containing 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608308 MGI: 1933148 HomoloGene: 32731 GeneCards: ABTB1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • translation elongation factor activity • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • ядерце • SCF ubiquitin ligase complex • цитоплазма • гіалоплазма • ubiquitin ligase complex
Біологічний процес	• translational elongation • Біосинтез білків • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of proteolysis
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


80325


80283

Ensembl


ENSG00000114626


ENSMUSG00000030083

UniProt


Q969K4


Q99LJ2

RefSeq (мРНК)


NM_032548 NM_172027 NM_172028


NM_030251 NM_001362152

RefSeq (білок)


NP_115937 NP_742024


NP_084527 NP_001349081

Локус (UCSC)

Хр. 3: 127.67 – 127.68 Mb

Хр. 6: 88.81 – 88.82 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ABTB1 (англ. Ankyrin repeat and BTB domain containing 1) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478 амінокислот, а молекулярна маса — 53 979^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDTSDLFASC	RKGDVGRVRY	LLEQRDVEVN	VRDKWDSTPL	YYACLCGHEE
LVLYLLANGA	RCEANTFDGE	RCLYGALSDP	IRRALRDYKQ	VTASCRRRDY
YDDFLQRLLE	QGIHSDVVFV	VHGKPFRVHR	CVLGARSAYF	ANMLDTKWKG
KSVVVLRHPL	INPVAFGALL	QYLYTGRLDI	GVEHVSDCER	LAKQCQLWDL
LSDLEAKCEK	VSEFVASKPG	TCVKVLTIEP	PPADPRLRED	MALLADCALP
PELRGDLWEL	PFPCPDGFNS	CPDICFRVAG	CSFLCHKAFF	CGRSDYFRAL
LDDHFRESEE	PATSGGPPAV	TLHGISPDVF	THVLYYMYSD	HTELSPEAAY
DVLSVADMYL	LPGLKRLCGR	SLAQMLDEDT	VVGVWRVAKL	FRLARLEDQC
TEYMAKVIEK	LVEREDFVEA	VKEEAAAVAA	RQETDSIPLV	DDIRFHVAST
VQTYSAIEEA	QQRLRALEDL	LVSIGLDC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до факторів елонгації. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Dai K.-S., Wei W., Liew C.-C. (2000). Molecular cloning and characterization of a novel human gene containing ankyrin repeat and double BTB/POZ domain. Biochem. Biophys. Res. Commun. 273: 991—996. PMID 10891360 DOI:10.1006/bbrc.2000.3053
Unoki M., Nakamura Y. (2001). Growth-suppressive effects of BPOZ and EGR2, two genes involved in the PTEN signaling pathway. Oncogene. 20: 4457—4465. PMID 11494141 DOI:10.1038/sj.onc.1204608
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18275 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q969K4 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.